BIO-RADCFXMaestro是一个化繁为简的BIO-RAD定量PCR数据处理大师，软件能够操作所有CFX系列实时定量PCR仪，进行实验设置、仪器操作和数据分析，软件全面整合了数据采集、统计学分析（t-检验、方差分析）和用于出版发表的结果导出功能，为实时定量PCR仪实验提供了一站式的解决方案。
软件应用
背景简介：
肌萎缩性脊髓侧索硬化症（amyotrophiclateralsclerosis，ALS），俗称“渐冻人”，是一种运动神经元疾病，病人表现出因上运动神经元和下运动神经元变性所致的肌无力、肌萎缩等症状。为研究其是否存在细胞自噬的病理，研究者将ALS患者和其他非ALS类型包括包涵体肌炎（inclusionbodymyositis，IBM，一种慢性炎症性肌病）样本等进行比较。观察ALS病理的一种已知标志物磷酸化TARDNA结合蛋白43（pTDP-43）以及调节细胞自噬的P62蛋白的特异性表达情况。除用到免疫组化、免疫荧光的方法外，研究人员也对这两种蛋白对应的基因TARDBP和SQSTM1进行了qPCR实验分析比较，以下是具体的过程。
样本设置：
ALS样本组——ALS1-ALS5共5个生物学重复；
IBM样本组——IBM1-IBM3共3个生物学重复；
阴性对照组——MSC1-MSC3共3个轻微神经源性肌萎缩样本生物学重复；
空白对照——1个无模板对照
基因设置：
2个目的基因——TARDBP，SQSTM1；
2个参考基因——GAPDH，RPS18；
所用到的染料法引物对均来自于Bio-Rad提供的PrimePCRAssay。
板面布局：
12个样本×4个基因，1个96孔板做2个重复，共做2个96孔板（即2个批次实验，各4个技术学重复）。
数据分析方法：
将TARDBP和SQSTM1表达用两个参考基因（GAPDH，RPS18）进行均一化，两组患者分别与对照组进行相对均一化基因表达比较，显著性检验采用非配对t检验。
